Az igazgatóság a vizsgálat során ellenőrzi a mezőgazdasági őstermelő által értékesíteni kívánt termék származását, az őstermelői igazolvány, értékesítési betétlap és az adatnyilvántartó lap adattartalmát.  Amennyiben az igazgatóság megállapítja az őstermelői igazolvány jogszerűtlen használatát, úgy két hónaptól két évig terjedő időtartamra visszavonhatja azt, illetve kiadására tilalmat rendelhet el.
 
Az igazgatóság az igazolvány használatának jogszerűsége és az abban foglalt adatok valódiságának vizsgálata során az alábbiakat ellenőrzi:
- a mezőgazdasági őstermelő által értékesíteni kívánt, értékesített termék származását.
- a mezőgazdasági őstermelői igazolvány, értékesítési betétlap és az adatnyilvántartó lap adattartalmát.

Az igazgatóság jogosult:
- az igazolványt visszatartani, ha az igazolványban és az adatnyilvántartó lapon feltüntetett értékesítésre szánt termékek köre és az értékesítő helyen lévő termékek eltérnek.
- az igazolványt visszavonni, ha a helyszíni ellenőrzés során megállapítást nyert, hogy a mezőgazdasági őstermelő által értékesíteni kívánt, vagy értékesített termék mennyisége 10 %-kal vagy azt meghaladó mértékben több mint amennyit az adatnyilvántartó lapján bejelentett, illetve a mezőgazdasági őstermelő saját gazdasága adatai alapján lehetősége van termelni.
 
Az ellenőrzés megállapításairól a földművelésügyi igazgatóságok értesítik az ügyben érintett egyéb hatóságokat is, akik saját hatáskörben további szankciókat foganatosíthatnak. A fentiekre tekintettel felhívjuk az őstermelők figyelmét, hogy csak a saját gazdaságukban előállított termékeket értékesíthetik, az értékesítési betétlap vezetése kötelező, azt negyedévente le kell zárni.